Inhoud
Peptiden zijn fragmenten van korte polymeren die zijn samengesteld uit aminozuren. Elk peptide heeft een bepaalde reeks aminozuren die wordt aangegeven met een drieletterige code of slechts één; het aminozuur alanine wordt bijvoorbeeld afgekort als "Ala" of "A". De hoeveelheid peptiden in de oplossing hangt af van de zuurgraad. Het iso-elektrische punt (pI) verwijst naar de zuurgraad van de oplossing waarin het peptidemolecuul een nettolading gelijk aan nul heeft. De oplosbaarheid van het peptide is minimaal op het iso-elektrische punt. Gebruik beschikbare webservers om de pI-waarde voor een aminozuursequentie van een peptide te berekenen.
Stap 1
Volg het peptide met behulp van de eenletterige code. Als een peptide bijvoorbeeld een aminozuursequentie Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Alanine - Serine - Glutaminezuur - Leucine - Proline) heeft, dan zou de eenletterige sequentie "ASELP" zijn. Raadpleeg indien nodig de conversietabel van één letter naar drie letters in het gedeelte Bronnen.
Stap 2
Gebruik elke browser, zoals Internet Explorer of Firefox, om een server in te voeren die het iso-elektrische punt van een peptide (pI) berekent; zie bronnen.
Stap 3
Typ de eenletterige reeks van het peptide - in ons voorbeeld "ASELP" - in het vak en klik op "Berekenen".
Stap 4
Lees de waarde van het iso-elektrische punt (pI) af, gegeven in de regel van "Theoretische pI / Mw" (theoretische pl). In ons voorbeeld is de pI 4,00. Merk op dat de server ook het molecuulgewicht (Mw) van het peptide berekent.